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  3. R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq
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연습 문제

피크 vs 백그라운드

이제 피크, 블랙리스트 영역, 그리고 백그라운드의 커버리지 분포를 비교해 보겠습니다. 이번 연습 문제에서는 5번 염색체 데이터를 살펴봐요. 이 염색체에서 피크, 블랙리스트 영역, 백그라운드의 빈(binned) 리드 카운트는 각각 peak_bins, bl_bins, bkg_bins로 제공됩니다. score 열에는 리드 카운트가 들어 있어요.

이 연습 문제에 필요한 모든 데이터와 R 패키지를 불러오는 데 잠시 시간이 걸릴 수 있습니다. 잠시만 기다려 주세요.

지침

100 XP
  • 데이터 프레임에 정리해서 플로팅용 리드 카운트를 준비하세요.
  • rbind()를 사용해 세 개의 데이터 프레임을 결합하세요.
  • 빈 유형별 리드 카운트에 대한 박스플롯을 만드세요.