볼케이노 플롯
볼케이노 플롯은 그룹 간 차이(로그 폴드 변화로 표현됨)와 피크 강도를 비교하는 검정의 p-값 간의 관계를 시각화합니다. 이를 통해 통계적으로 유의한 결과와 그 효과 크기를 한눈에 파악할 수 있어요. DiffBind에는 이러한 플롯을 만드는 dba.plotVolcano() 함수가 제공됩니다.
ar_diff 객체에는 차등 결합 분석 결과가 들어 있습니다.
이 연습은 강의의 일부입니다
R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq
연습 안내
- 볼케이노 플롯을 만드세요.
- 플롯을 살펴보세요. 유의한 결과는 어디에 위치하나요?
실습형 인터랙티브 연습
이 예제를 이 샘플 코드를 완성하여 풀어보세요.
# Create a volcano plot
___(ar_diff)