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리드 카운트 불러오기

비디오에서 보신 것처럼, 차등 결합을 검정하려면 먼저 합의 피크 호출 집합을 만들어야 해요. 이는 다음 R 코드 한 줄로 수행할 수 있어요:

ar_counts <- dba.count(ar_peaks, summits=200)

다음 문장을 고려해 보세요.

  1. ar_counts에서는 모든 샘플이 동일한 피크 호출 집합에 대한 리드 카운트를 갖습니다.
  2. 일부 리드 카운트는 0일 수 있습니다.
  3. ar_counts의 모든 피크는 200 bp 너비입니다.
  4. ar_counts의 모든 피크는 400 bp 너비입니다.

이 중에서 옳은 것은 무엇인가요?

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R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq

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