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Bài tập

PCA와 히트맵 다시 살펴보기

이제 샘플 간의 주요 차이를 파악했으니, 샘플을 비교하는 또 다른 플롯 세트를 만들어 볼게요. 이전에 살펴본 플롯과 매우 비슷하지만, 이번에는 차등 결합된 피크만 사용합니다. 이렇게 하면 플롯의 잡음을 줄이고 차이를 더 잘 부각할 수 있어요. DiffBind의 플로팅 함수에는 어떤 비교를 기준으로 플로팅할 피크를 선택할지 지정하는 contrast 인자가 있습니다. 이 연습에서는 원래 플롯과 정리된 버전을 비교해 보겠습니다.

Hướng dẫn 1/4

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  • 모든 피크를 사용해 PCA 플롯을 만드세요.