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연습 문제

단백질 결합 차이 요약하기

이번 레슨에서 살펴볼 차등 결합 피크의 마지막 플롯은 박스 플롯입니다. 이 플롯은 각 샘플에서 피크 강도의 분포를 요약해 보여주는 데 유용해요. 이를 위해 DiffBind는 dba.plotBox() 함수를 제공합니다. 박스 플롯은 그룹별 중앙값의 위치와 그 주변의 데이터 분산을 한눈에 보여줍니다. DiffBind가 생성하는 플롯은 두 그룹(원발 종양과 치료 내성 종양)과, 차등 결합 피크로 구성된 하위 그룹들을 함께 비교합니다. 플롯 자체와 더불어, dba.plotBox()는 이러한 그룹 간 쌍별 비교에 대한 p-value도 반환해요.

앞서와 마찬가지로, 차등 결합 분석 결과는 ar_diff로 제공됩니다.

지침

100 XP
  • 피크 강도의 박스 플롯을 만드세요.
  • 반환된 p-value를 확인하세요. 어떤 피크 집합들이 서로 유의하게 다른가요?