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  3. R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq
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Exercise

BED 파일 읽기

이 연습 문제에서는 BED 파일에서 피크 호출을 불러오고, 피크 위치 정보를 사용해 BAM 파일에서 피크와 겹치는 리드를 추출해 보겠습니다.

Instructions

100 XP
  • import.bed 함수를 사용해 chr20_peaks에서 피크 호출을 불러오세요.
  • 이 피크 호출을 사용해 chr20_bam에 대한 BamViews 객체를 만드세요.
  • 피크 호출과 겹치는 리드를 불러오세요.