BED 파일 읽기
이 연습 문제에서는 BED 파일에서 피크 호출을 불러오고, 피크 위치 정보를 사용해 BAM 파일에서 피크와 겹치는 리드를 추출해 보겠습니다.
이 연습은 강의의 일부입니다
R에서 Bioconductor로 배우는 ChIP-seq
연습 안내
import.bed함수를 사용해 chr20_peaks에서 피크 호출을 불러오세요.- 이 피크 호출을 사용해 chr20_bam에 대한
BamViews객체를 만드세요. - 피크 호출과 겹치는 리드를 불러오세요.
실습형 인터랙티브 연습
이 예제를 이 샘플 코드를 완성하여 풀어보세요.
# Load peak calls from chr20_peaks
peaks <- ___(chr20_peaks)
# Create a BamViews object
bam_views <- ___(___, bamRanges=peaks)
# Load the reads
reads <- ___(___)