Créer un diagramme à boîtes
Explorez l'ensemble de données sur la leucémie en visualisant les niveaux d'expression du premier gène au moyen de diagrammes à boîtes pour les patientes et patients ayant une leucémie stable ou évolutive.
Cette activité fait partie du cours
Analyse d'expression différentielle avec limma dans R
Instructions de l’exercice
La matrice d'expression (x), les données de caractéristiques (f) et les données phénotypiques (p) sont chargées dans votre espace de travail.
Sélectionnez dans
xuniquement le premier gène (c.-à-d. la première ligne) et insérez-le à gauche du~dans la formule (axe des y).Sélectionnez dans
puniquement la colonne"Disease"et insérez-la à droite du~dans la formule (axe des x).Sélectionnez dans
funiquement le premier gène (c.-à-d. la première ligne) et la colonne"symbol". Utilisez cela comme argumentmainpour le titre du graphique.
Exercice interactif pratique
Essayez cet exercice en complétant ce code d’exemple.
# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)