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Cette activité fait partie du cours
Pour commencer, vous reverrez les objectifs de l'analyse d'expression différentielle, vous manipulerez des données d'expression génique avec R et Bioconductor, puis vous exécuterez votre première analyse d'expression différentielle avec limma.
Dans ce chapitre, vous apprendrez à construire des modèles linéaires pour tester l'expression différentielle dans des plans expérimentaux courants.
Maintenant que vous savez réaliser des tests d'expression différentielle, vous apprendrez à normaliser et filtrer les caractéristiques, à vérifier les effets de lot techniques et à évaluer les résultats.
Dans ce dernier chapitre, vous mettrez en pratique vos nouvelles compétences pour effectuer de bout en bout une analyse d'expression différentielle d'une étude utilisant un plan factoriel afin d'évaluer l'impact du médicament anticancéreux doxorubicine sur le cœur de souris ayant différents arrière-plans génétiques.
Exercice en cours