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繪製箱型圖

用箱型圖視覺化第一個基因的表現量,並依「穩定型」與「進展型」白血病病患分組,來探索這個白血病資料集。

本練習屬於課程

使用 R 中的 limma 進行差異表達分析

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練習說明

表現量矩陣(x)、特徵資料(f),以及表現型資料(p)都已載入到你的工作環境中。

  • x 子集化為只包含第一個基因(亦即第 1 列),並把它放在公式中 ~ 的左側(y 軸)。

  • p 子集化為只包含 "Disease" 這一欄,並把它放在公式中 ~ 的右側(x 軸)。

  • f 子集化為只包含第一個基因(亦即第 1 列)與 "symbol" 這一欄。把這個結果作為繪圖標題的 main 參數。

動手互動練習

試著完成這個範例程式碼,體驗一下這個練習。

# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)
編輯並執行程式碼