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Exercise

PCA とヒートマップをもう一度

サンプル間の主な違いを特定できたので、サンプルを比較する別のプロットを作成しましょう。以前に見たものと非常によく似ていますが、今回は差次的に結合しているピークのみを使用します。これによりプロット内のノイズが減り、違いが強調されます。DiffBind の描画関数には、どの比較を使ってプロット用のピークを選ぶかを指定できる contrast 引数があります。この演習では、元のプロットと、ノイズを取り除いたプロットを見比べます。

Instrukcje 1 / 4

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  • すべて のピークを使って PCA プロットを作成します。