ボルケーノプロット
ボルケーノプロットは、グループ間の差（log fold change で表現）と、ピーク強度を比較する検定の p 値との関係を可視化します。これにより、統計的に有意な結果とその効果量をひと目で把握できます。DiffBind には、これらのプロットを作成する dba.plotVolcano() 関数があります。
ar_diff オブジェクトには、差次的結合解析の結果が含まれています。
この演習はコースの一部です
Rで学ぶBioconductorによるChIP-seq
演習の手順
- ボルケーノプロットを作成してください。
- プロットを確認しましょう。有意な結果はどこに位置していますか？
実践的なインタラクティブ演習
このサンプルコードを完成させて、この演習に挑戦してみましょう。
# Create a volcano plot
___(ar_diff)