リードカウントの読み込み

ビデオで見たように、差次的結合を検定する前にコンセンサスのピークコール集合を作成する必要があります。これは次の R コードで実行できます。

ar_counts <- dba.count(ar_peaks, summits=200)

次の記述を考えてみましょう。

1. ar_counts では、すべてのサンプルが同じピークコール集合に対するリードカウントを持ちます。
2. リードカウントが 0 になるものもあります。
3. ar_counts のすべてのピークは幅 200 bp です。
4. ar_counts のすべてのピークは幅 400 bp です。

どの記述が正しいでしょうか。