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Bài tập

モデルを当てはめる

これで差次的結合解析を実行する準備ができました。これは、2つの腫瘍タイプ間でどのピークの強度が有意に異なるかを明らかにします。グループ間で異なるピークがわかれば、そうした差を生み出す基盤となるメカニズムを解明するための後続解析の土台になります。ここでは、差次的に結合しているピークを見つけていきます。DiffBind の dba.analyze() 関数を使うと実行できます。前の演習では、腫瘍タイプ間を比較するためのコントラストを設定しました。コントラストを含むオブジェクトを使えば、あとは dba.analyze() を呼ぶだけで残りの処理が行えます。

Hướng dẫn

100 XP
  • ar_binding オブジェクトを確認し、必要なコントラストが含まれていることを確かめてください。
  • 差次的結合解析を実行してください。
  • 結果を確認してください。