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  3. Rで学ぶBioconductorによるChIP-seq
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연습 문제

BED ファイルを読み込む

この演習では、BED ファイルからピークコールを読み込み、ピークの位置情報を使って、BAM ファイルからピークと重なるリードを抽出します。

지침

100 XP
  • import.bed 関数を使って、chr20_peaks からピークコールを読み込みます。
  • これらのピークコールを使って、chr20_bam の BamViews オブジェクトを作成します。
  • ピークコールと重なるリードを読み込みます。