रीड्स पूरे जीनोम में बिखरी होती हैं, लेकिन जिस प्रोटीन में आपकी रुचि है उसके द्वारा बाउंड की गई लोकेशंस पर कई ओवरलैपिंग रीड्स इकट्ठा हो जाती हैं, जिससे कवरेज में पीक्स बनते हैं। आम तौर पर इन पीक्स को उनके जीनोमिक कोऑर्डिनेट्स के साथ रिकॉर्ड किया जाता है, साथ ही एक स्कोर भी रखा जाता है जो इस पीक के लिए देखे गए सिग्नल की स्ट्रेंथ दर्शाता है।

आपके लिए R में पीक कॉल्स का एक सेट लोड किया गया है। ये पीक कॉल्स peaks नाम के GenomicRanges ऑब्जेक्ट में स्टोर हैं। GenomicRanges ऑब्जेक्ट्स की सामग्री एक्सेस करने वाले सामान्य फंक्शंस के अलावा, पीक कॉल्स के लिए दो सुविधाजनक फंक्शंस उपलब्ध हैं। आप chrom फंक्शन का उपयोग करके वह क्रोमोसोम पा सकते हैं जिस पर पीक स्थित है, और score फंक्शन से उसका स्कोर प्राप्त कर सकते हैं।

ChIP-seq परिणामों का सारांश

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