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Read Counts लोड करना

जैसा आपने वीडियो में देखा, differential binding को test करने से पहले आपको consensus peak calls का एक set बनाना होता है। इसे आप निम्न R कोड से कर सकते हैं:

ar_counts <- dba.count(ar_peaks, summits=200)

निम्न कथनों पर विचार करें।

  1. ar_counts में सभी samples के read counts एक ही set of peak calls के लिए होंगे।
  2. कुछ read counts 0 हो सकते हैं।
  3. ar_counts में सभी peaks 200 bp चौड़े हैं।
  4. ar_counts में सभी peaks 400 bp चौड़े हैं।

इनमें से कौन-से कथन सही हैं?

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R में Bioconductor के साथ ChIP-seq

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