फ़िल्टर्ड डेटा की तुलना रॉ रीड्स से करें
आइए देखें कि रीड फ़िल्टरिंग से क्या फ़र्क पड़ता है. नीचे दिए गए प्लॉट में तीन अलग-अलग कवरेज ट्रैक हैं. ऊपर से नीचे तक क्रमशः टोटल कवरेज, उच्च-गुणवत्ता एलाइनमेंट्स से कवरेज, और निम्न-गुणवत्ता एलाइनमेंट्स से कवरेज दिखाया गया है.
ऊपर दिए गए प्लॉट की जाँच कीजिए. नीचे में से कौन-से कथन दर्शाए गए कवरेज डेटा का सही वर्णन करते हैं?
- ज़्यादातर रीड एलाइनमेंट्स उच्च-गुणवत्ता के थे.
- सबसे उभरे हुए पीक निम्न-गुणवत्ता एलाइनमेंट्स के कारण हैं.
- उच्च-गुणवत्ता कवरेज प्रोफ़ाइल में पीक मौजूद हैं.
यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है
R में Bioconductor के साथ ChIP-seq
इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास
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