वोल्केनो प्लॉट
वोल्केनो प्लॉट्स समूहों के बीच के अंतर (log fold change के रूप में व्यक्त) और पीक इंटेंसिटी की तुलना करने वाले टेस्ट के p-value के बीच संबंध को विज़ुअलाइज़ करते हैं. इससे सांख्यिकीय रूप से महत्वपूर्ण परिणामों और उनके effect size का एक विज़ुअल ओवरव्यू मिलता है. इन प्लॉट्स को बनाने के लिए DiffBind फ़ंक्शन dba.plotVolcano() प्रदान करता है.
ar_diff ऑब्जेक्ट में differential binding विश्लेषण के परिणाम शामिल हैं.
यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है
R में Bioconductor के साथ ChIP-seq
अभ्यास निर्देश
- एक वोल्केनो प्लॉट बनाएँ.
- प्लॉट का निरीक्षण करें. महत्वपूर्ण परिणाम कहाँ स्थित होते हैं?
इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास
इस अभ्यास को इस नमूना कोड को पूरा करके आज़माएँ।
# Create a volcano plot
___(ar_diff)