PCA और Heat map पर फिर से नज़र

अब जब आपने सैंपल्स के बीच मुख्य अंतर पहचान लिए हैं, तो आप सैंपल्स की तुलना करने के लिए प्लॉट्स का एक और सेट बना सकते हैं। ये पहले देखे गए प्लॉट्स के बहुत समान हैं, लेकिन इस बार आप केवल differentially bound peaks का उपयोग कर रहे हैं। इससे प्लॉट में शोर कम होता है और अंतर ज्यादा स्पष्ट दिखते हैं। DiffBind के plotting फंक्शन में contrast नाम का एक आर्ग्युमेंट होता है, जो आपको यह निर्धारित करने देता है कि प्लॉटिंग के लिए peaks चुनने में कौन-सी तुलना इस्तेमाल की जाए। इस अभ्यास में, आप मूल प्लॉट्स की उनके साफ-सुथरे संस्करणों से तुलना करेंगे।