शुरू करेंमुफ़्त में शुरू करें

क्या ये सैंपल्स आपको एक जैसे लगते हैं?

PCA प्लॉट देख कर आप सैंपल्स के बीच समानताओं और भिन्नताओं का एक समग्र अंदाज़ा लगा सकते हैं। सैंपल QC के दौरान जनरेट हुए आउटपुट का उपयोग करके प्रोसेस्ड डेटा के PCA प्लॉट बनाना सीधा होता है। नीचे QC पास करने वाले सभी चार सैंपल्स का प्लॉट दिया है।

प्लॉट देखें और फिर नीचे दिए गए कथनों पर विचार करें। इनमें से कौन से सही हैं?

  1. सैंपल्स कंडीशन के अनुसार क्लस्टर होते हैं।
  2. ऐसा प्लॉट plotPrincomp() फंक्शन से बनाया जा सकता है।
  3. PCA प्लॉट का उपयोग करके यह देखना आसान है कि कौन से पीक्स समूहों के बीच सबसे अधिक अलग हैं।

यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है

R में Bioconductor के साथ ChIP-seq

पाठ्यक्रम देखें

इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास

हमारे इंटरैक्टिव अभ्यासों में से किसी एक के साथ सिद्धांत को व्यवहार में बदलें

अभ्यास शुरू करें