MA प्लॉट
MA प्लॉट दो समूहों के बीच औसत सिग्नल इंटेंसिटी के सापेक्ष अंतर को विज़ुअलाइज़ करता है. यह डेटा में संभावित बायस का आकलन करने में उपयोगी है. आम तौर पर, ज़्यादातर पीक इंटेंसिटी कंडीशनों के बीच नहीं बदलती. इसका मतलब है कि प्लॉट में पॉइंट्स 0 पर एक क्षैतिज रेखा के आसपास समूहित होने चाहिए, जो किसी बदलाव न होने का संकेत है. MA प्लॉट्स से आप यह भी जल्दी समझ सकते हैं कि समूहों के बीच अंतर कितना बड़ा है.
जैसे आपने पहले प्लॉटिंग फंक्शंस इस्तेमाल किए थे, वैसे ही DiffBind एक फंक्शन dba.plotMA() देता है, जो DBA ऑब्जेक्ट से सारी ज़रूरी जानकारी लेकर MA प्लॉट बना सकता है.
यह अभ्यास पाठ्यक्रम का हिस्सा है
R में Bioconductor के साथ ChIP-seq
अभ्यास निर्देश
dba.plotMA()फंक्शन का उपयोग करके एक MA प्लॉट बनाएँ.- प्लॉट देखें. ध्यान दें कि महत्वपूर्ण अंतर कैसे हाइलाइट किए गए हैं.
इंटरैक्टिव व्यावहारिक अभ्यास
इस अभ्यास को इस नमूना कोड को पूरा करके आज़माएँ।
# Create an MA plot
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