Ces échantillons vous semblent-ils identiques?
Examiner des graphiques d'ACP permet d'avoir un aperçu des similarités et des différences entre échantillons à l'échelle globale. À partir des résultats produits lors de l'assurance qualité (QC) des échantillons, il est simple de générer des graphiques d'ACP sur les données traitées. Ci-dessous, un graphique pour les quatre échantillons qui ont passé le QC.

Examinez le graphique, puis considérez les énoncés suivants. Lesquels sont vrais?
- Les échantillons se regroupent par condition.
- Un graphique comme celui-ci peut être créé avec la fonction
plotPrincomp(). - À l'aide d'un graphique d'ACP, il est facile de voir quels pics diffèrent le plus entre les groupes.
Cette activité fait partie du cours
ChIP-seq avec Bioconductor en R
Exercice interactif pratique
Passez de la théorie à l’action grâce à l’un de nos exercices interactifs
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