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Ces échantillons vous semblent-ils identiques?

Examiner des graphiques d'ACP permet d'avoir un aperçu des similarités et des différences entre échantillons à l'échelle globale. À partir des résultats produits lors de l'assurance qualité (QC) des échantillons, il est simple de générer des graphiques d'ACP sur les données traitées. Ci-dessous, un graphique pour les quatre échantillons qui ont passé le QC.

Examinez le graphique, puis considérez les énoncés suivants. Lesquels sont vrais?

  1. Les échantillons se regroupent par condition.
  2. Un graphique comme celui-ci peut être créé avec la fonction plotPrincomp().
  3. À l'aide d'un graphique d'ACP, il est facile de voir quels pics diffèrent le plus entre les groupes.

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ChIP-seq avec Bioconductor en R

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