Sestavení modelu

Teď je čas provést analýzu diferenciální vazby. Ta ti ukáže, které peaky se výrazně liší v intenzitě mezi dvěma typy nádorů. Zjistit, které peaky se mezi skupinami liší, bude základem pro další analýzy zaměřené na odhalení mechanismů stojících za těmito rozdíly. Prozatím se soustřeďme na hledání diferenciálně vázaných peaků. Funkce dba.analyze() z balíčku DiffBind ti s tím pomůže. V předchozím cvičení jsi nastavil/a kontrast pro porovnání mezi typy nádorů. S objektem obsahujícím tento kontrast stačí jednoduše zavolat dba.analyze() a o zbytek se postará sama.

Prozkoumej objekt ar_binding a ověř, že obsahuje požadovaný kontrast.
Spusť analýzu diferenciální vazby.
Prozkoumej výsledek.

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}cvičení

Pokyny

cvičení