Shrnutí rozdílů ve vazbě proteinů

Posledním typem grafu pro vizualizaci diferenciálně vázaných peaků, na který se v této lekci podíváme, je krabicový graf (box plot). Tento typ grafu se hodí ke shrnutí rozložení intenzit peaků v jednotlivých vzorcích. DiffBind k tomu nabízí funkci dba.plotBox(). Krabicové grafy zvýrazňují polohu mediánu v různých skupinách i rozptyl dat kolem něj. Graf generovaný DiffBind porovnává dvě skupiny (primární nádor a nádor rezistentní na léčbu) i podskupiny tvořené diferenciálně vázanými peaky. Kromě samotného grafu vrací dba.plotBox() také p-hodnoty pro párová srovnání mezi těmito skupinami.

Výsledky analýzy diferenciální vazby jsou stejně jako dříve dostupné jako ar_diff.

Vytvoř krabicový graf intenzit peaků.
Prohlédni si vrácené p-hodnoty. Které sady peaků se od sebe statisticky významně liší?

연습 문제

Shrnutí rozdílů ve vazbě proteinů

지침

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}연습 문제

지침

연습 문제