1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. ChIP-seq s Bioconductor v R
Connected

cvičení

Načítání BED souborů

V tomto cvičení načteš peak calls z BED souboru a využiješ informace o umístění peaků k extrakci readů, které se s nimi překrývají, z BAM souboru.

Pokyny

100 XP
  • Pomocí funkce import.bed načti peak calls ze souboru chr20_peaks.
  • Na základě těchto peak calls vytvoř objekt BamViews pro soubor chr20_bam.
  • Načti ready překrývající se s peak calls.