1. Učit se
    2. /
  2. Kurzy
    3. /
  3. ChIP-seq s Bioconductor v R
Connected

cvičení

Peaky vs. pozadí

Teď je čas porovnat rozložení pokrytí u peaků, blacklistovaných oblastí a pozadí. V tomto cvičení se podíváš na data z chromozomu 5. Binované počty čtení pro peaky, blacklistované oblasti a pozadí jsou pro tento chromozom dostupné jako peak_bins, bl_bins a bkg_bins. Sloupec score obsahuje počty čtení.

Načtení všech potřebných dat a R balíčků může chvíli trvat. Buď prosím trpělivý/á.

Pokyny

100 XP
  • Připrav počty čtení pro vizualizaci tak, že je uspořádáš do datových rámců.
  • Spoj všechny tři datové rámce pomocí rbind().
  • Vytvoř krabicový graf počtů čtení podle typu binu.