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绘制箱线图

通过可视化首个基因的表达水平,并为稳定期与进展期白血病患者分别绘制箱线图,来探索该白血病数据集。

本练习是课程的一部分

在 R 中使用 limma 进行差异表达分析

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练习说明

表达矩阵(x)、特征数据(f)和表型数据(p)已加载到您的工作区。

  • x 子集化为仅包含第一个基因(即第一行),并把它放在公式中 ~ 的左侧(y 轴)。

  • p 子集化为仅包含列 "Disease",并把它放在公式中 ~ 的右侧(x 轴)。

  • f 子集化为仅包含第一个基因(即第一行)以及列 "symbol"。将其作为 main 参数,用作图形标题。

交互式实操练习

通过完成这段示例代码来试试这个练习。

# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)
编辑并运行代码