绘制箱线图
通过可视化首个基因的表达水平,并为稳定期与进展期白血病患者分别绘制箱线图,来探索该白血病数据集。
本练习是课程的一部分
在 R 中使用 limma 进行差异表达分析
练习说明
表达矩阵(x)、特征数据(f)和表型数据(p)已加载到您的工作区。
将
x子集化为仅包含第一个基因(即第一行),并把它放在公式中~的左侧(y 轴)。将
p子集化为仅包含列"Disease",并把它放在公式中~的右侧(x 轴)。将
f子集化为仅包含第一个基因(即第一行)以及列"symbol"。将其作为main参数,用作图形标题。
交互式实操练习
通过完成这段示例代码来试试这个练习。
# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)