ПочатиПочніть безкоштовно

Завантаження кількостей ридів

Як ви бачили у відео, перш ніж перевіряти диференційне зв'язування, потрібно створити набір узгоджених піків. Це можна зробити такою командою R:

ar_counts <- dba.count(ar_peaks, summits=200)

Розгляньте наведені твердження.

  1. У ar_counts всі зразки матимуть кількості ридів для одного й того самого набору викликаних піків.
  2. Деякі кількості ридів можуть дорівнювати 0.
  3. Усі піки в ar_counts мають ширину 200 bp.
  4. Усі піки в ar_counts мають ширину 400 bp.

Які з цих тверджень є істинними?

Ця вправа є частиною курсу

ChIP-seq з Bioconductor у R

Переглянути курс

Практична інтерактивна вправа

Перетворіть теорію на практику за допомогою однієї з наших інтерактивних вправ

Почати вправу