Завантаження кількостей ридів
Як ви бачили у відео, перш ніж перевіряти диференційне зв'язування, потрібно створити набір узгоджених піків. Це можна зробити такою командою R:
ar_counts <- dba.count(ar_peaks, summits=200)
Розгляньте наведені твердження.
- У
ar_countsвсі зразки матимуть кількості ридів для одного й того самого набору викликаних піків. - Деякі кількості ридів можуть дорівнювати 0.
- Усі піки в
ar_countsмають ширину 200 bp. - Усі піки в
ar_countsмають ширину 400 bp.
Які з цих тверджень є істинними?
Ця вправа є частиною курсу
ChIP-seq з Bioconductor у R
Практична інтерактивна вправа
Перетворіть теорію на практику за допомогою однієї з наших інтерактивних вправ
Почати вправу