Alla scoperta del genoma del lievito
Inizierai a esplorare il genoma del lievito usando il pacchetto BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, che è già installato per te.
Come per altri dati in R, puoi usare head() e tail() per esplorare l'oggetto yeastGenome. Puoi anche creare sottoinsiemi del genoma per cromosoma usando la sintassi $ come segue: object_name$chromosome_name.
I nomi dei cromosomi si ottengono con la funzione names() e nchar() può essere usata per contare il numero di caratteri in una sequenza.
Questo esercizio fa parte del corso
Introduzione a Bioconductor in R
Esercizio pratico interattivo
Prova a risolvere questo esercizio completando il codice di esempio.
# Load the yeast genome
___
# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___