Interagire con IRanges
Puoi usare la funzione IRanges() per creare una singola sequenza. Puoi anche passare dei vettori a IRanges() per creare più intervalli di sequenza nello stesso momento. Questo è sia interessante che utile! La creazione degli oggetti seq_1 e seq_2 ne è un esempio.
Per questo esercizio, controlla l’ampiezza di ciascuna delle sequenze fornite qui, usando width() e lengths(). Nota la differenza tra i due tipi di risultati.
Ricorda che width = end - start + 1.
Questo esercizio fa parte del corso
Introduzione a Bioconductor in R
Esercizio pratico interattivo
Prova a risolvere questo esercizio completando il codice di esempio.
# Create the first sequence seq_1
seq_1 <- IRanges(start = 10, end = 37)
# Create the second sequence seq_2
seq_2 <- IRanges(start = c(5, 35, 50),
end = c(12, 39, 61),
names = LETTERS[1:3])
# Check the width of seq_1 and seq_2
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