Manipolare Biostrings
Usando una breve sequenza (dna_seq) dall'oggetto zikaVirus, tocca a te mettere in pratica i due processi biologici di trascrizione e traduzione.
Nelle prime due parti di questo esercizio applicherai questi processi separatamente. Nell’ultima parte, li applicherai in un unico passaggio.
In questo esercizio userai una sequenza molto piccola, ma ricorda che la potenza di Biostrings emerge quando si manipolano sequenze molto più grandi.
Il pacchetto Biostrings è già stato caricato per te. Usando zikaVirus, tradurrai i primi 21 caratteri in un AAString.
Questo esercizio fa parte del corso
Introduzione a Bioconductor in R
Esercizio pratico interattivo
Prova a risolvere questo esercizio completando il codice di esempio.
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq