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Perché fastq?

Finora ti è stato presentato il pacchetto ShortRead con strumenti utili per le fasi iniziali dell’analisi di sequenze a lettura corta. In sintesi, le funzionalità principali di questo pacchetto sono:

  • Input dei dati
  • Valutazione della qualità
  • Trasformazione dei dati
  • Accesso ad analisi a valle

In questo contesto, hai incontrato due diversi tipi di file: fasta e fastq.

Secondo te, qual è il motivo per usare file in formato fastq?

Questo esercizio fa parte del corso

Introduzione a Bioconductor in R

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Esercizio pratico interattivo

Passa dalla teoria alla pratica con uno dei nostri esercizi interattivi

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