Perché fastq?
Finora ti è stato presentato il pacchetto ShortRead con strumenti utili per le fasi iniziali dell’analisi di sequenze a lettura corta. In sintesi, le funzionalità principali di questo pacchetto sono:
- Input dei dati
- Valutazione della qualità
- Trasformazione dei dati
- Accesso ad analisi a valle
In questo contesto, hai incontrato due diversi tipi di file: fasta e fastq.
Secondo te, qual è il motivo per usare file in formato fastq?
Questo esercizio fa parte del corso
Introduzione a Bioconductor in R
Esercizio pratico interattivo
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