Funzioni comuni per la manipolazione di sequenze
Finora hai imparato le funzioni più comuni per manipolare le sequenze:
reverse()
complement()
reverseComplement()
translate()
Nella pratica, puoi manipolare sequenze davvero grandi usando queste funzioni.
Tuttavia, per apprezzarne il valore e vedere chiaramente i risultati in questo esercizio, userai un piccolo sottoinsieme. L'oggetto zikv, che hai già ottenuto come sottoinsieme del genoma di Zika, contiene solo 30 basi.
Questo esercizio fa parte del corso
Introduzione a Bioconductor in R
Istruzioni dell'esercizio
Metti alla prova le funzioni usando zikv:
- Inverti la sequenza.
- Calcola il complementare della sequenza.
- Calcola il complemento inverso della sequenza.
- Traduci la sequenza.
Esercizio pratico interattivo
Prova a risolvere questo esercizio completando il codice di esempio.
# Reverse the zikv sequence
reverse(___)
# Complement the zikv sequence
___
# Reverse complement the zikv sequence
___
# Translate the zikv sequence
___