Esplorare la sequenza del virus Zika
Ora tocca a te esplorare il genoma del virus Zika, caricato nel tuo workspace come zikaVirus. Il genoma è stato scaricato da NCBI e puoi applicare le funzioni di Biostrings per saperne di più.
Inizia controllando l'alfabeto della sequenza.
alphabet() # Mostra le lettere incluse nella sequenza
alphabetFrequency() # Mostra il conteggio per lettera
Ricorda dal video che a ogni alfabeto corrisponde uno specifico contenitore biostring e che di solito ogni alfabeto include lettere e simboli extra.
Questo esercizio fa parte del corso
Introduzione a Bioconductor in R
Esercizio pratico interattivo
Prova a risolvere questo esercizio completando il codice di esempio.
# Load packages
library(Biostrings)
# Check the alphabet of the zikaVirus
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