Ricerca di un pattern
Trova alcune occorrenze di un pattern nell'insieme zikaVirus usando vmatchPattern(). Poi prova la stessa ricerca di pattern usando matchPattern() con una singola sequenza, zikv.
# Per insiemi
vmatchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG",
subject = zikaVirus, max.mismatch = 1)
# Per singole sequenze
matchPattern(pattern = "ACATGGGCCTACCATGGGAG",
subject = zikv, max.mismatch = 1)
Entrambe le funzioni dovrebbero trovare lo stesso numero di occorrenze, ma noterai un output diverso. Quante corrispondenze otteniamo eseguendo ciascuna ricerca del pattern separatamente?
Questo esercizio fa parte del corso
Introduzione a Bioconductor in R
Esercizio pratico interattivo
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