IniziaInizia gratis

Rimozione dei duplicati

È sempre una buona pratica controllare che le tue read di sequenza non contengano troppe duplicazioni.

# Esempio con duplicati di classe: ShortReadQ
dfqsample

# Ottieni le read da dfqsample
mydReads <- sread(dfqsample)

# Conteggio dei duplicati
table(srduplicated(mydReads))

Come rimuoveresti le read duplicate in un file? Fai attenzione a quale condizione usare in questo filtro.

Questo esercizio fa parte del corso

Introduzione a Bioconductor in R

Visualizza il corso

Esercizio pratico interattivo

Passa dalla teoria alla pratica con uno dei nostri esercizi interattivi

Inizia esercizio