Una finestra di sequenza
Per suddividere temporaneamente sezioni delle tue sequenze, userai il concetto di finestre di ampiezza definita che possono spostarsi a passi. Come hai visto nel video, GRanges fornisce la funzione slidingWindows(), con argomenti come width e step.
slidingWindows(x, width, step = 1L)
L'oggetto GRanges chiamato ABCD1, con gene id 215 e lunghezza 19895, è stato precaricato per questo esercizio. Usa la funzione ranges() per vederne la struttura.
ranges(ABCD1)
Se ti servissero esattamente 2 finestre usando step = 1L, qual è il numero massimo consentito per l'ampiezza di ciascuna finestra?
Questo esercizio fa parte del corso
Introduzione a Bioconductor in R
Esercizio pratico interattivo
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