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Erstelle ein Boxplot

Erkunde den Leukämie-Datensatz, indem du die Expressionswerte des ersten Gens mit Boxplots für Patient:innen mit stabiler und progressiver Leukämie visualisierst.

Diese Übung ist Teil des Kurses

<Kurs>Differenzielle Expressionsanalyse mit limma in R</Kurs>
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Übungsanweisungen

Die Expressionsmatrix (x), die Feature-Daten (f) und die Phänotypdaten (p) sind in deinem Workspace geladen.

  • Bilde ein Subset von x, das nur das erste Gen (also die erste Zeile) enthält, und setze es links vom ~ in die Formel (y-Achse).

  • Bilde ein Subset von p, das nur die Spalte "Disease" enthält, und setze es rechts vom ~ in die Formel (x-Achse).

  • Bilde ein Subset von f, das nur das erste Gen (also die erste Zeile) und die Spalte "symbol" enthält. Verwende dies als Argument für main für den Plot-Titel.

Interaktive praktische Übung

Versuche dich an dieser Übung, indem du diesen Beispielcode vervollständigst.

# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)
Code bearbeiten und ausführen