Erstelle ein Boxplot
Erkunde den Leukämie-Datensatz, indem du die Expressionswerte des ersten Gens mit Boxplots für Patient:innen mit stabiler und progressiver Leukämie visualisierst.
Diese Übung ist Teil des Kurses
Differenzielle Expressionsanalyse mit limma in R
Anleitung zur Übung
Die Expressionsmatrix (x), die Feature-Daten (f) und die Phänotypdaten (p) sind in deinem Workspace geladen.
Bilde ein Subset von
x, das nur das erste Gen (also die erste Zeile) enthält, und setze es links vom~in die Formel (y-Achse).Bilde ein Subset von
p, das nur die Spalte"Disease"enthält, und setze es rechts vom~in die Formel (x-Achse).Bilde ein Subset von
f, das nur das erste Gen (also die erste Zeile) und die Spalte"symbol"enthält. Verwende dies als Argument fürmainfür den Plot-Titel.
Interaktive Übung
Vervollständige den Beispielcode, um diese Übung erfolgreich abzuschließen.
# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)