重新檢視 PCA 與熱圖
既然你已經找出樣本之間的主要差異,現在可以建立另一組圖來比較樣本。這些圖與你先前看到的非常相似,但這次只使用差異性結合(differentially bound)的峰值。這能減少圖中的雜訊,並有助於凸顯差異。DiffBind 的繪圖函式有一個 contrast 參數,讓你指定要用哪一個比較來挑選要繪圖的峰值。在本練習中,你會將原始圖與清理後的對應圖進行比較。
本練習屬於課程
既然你已經找出樣本之間的主要差異,現在可以建立另一組圖來比較樣本。這些圖與你先前看到的非常相似,但這次只使用差異性結合(differentially bound)的峰值。這能減少圖中的雜訊,並有助於凸顯差異。DiffBind 的繪圖函式有一個 contrast 參數,讓你指定要用哪一個比較來挑選要繪圖的峰值。在本練習中,你會將原始圖與清理後的對應圖進行比較。
本練習屬於課程