Volcano plot
Volcano plot 以群組間的差異(以對數倍數變化 log fold change 表示)與比較峰值強度的檢定 p 值之間的關係來視覺化。這能提供統計顯著結果及其效果量的整體概觀。DiffBind 提供 dba.plotVolcano() 函式來建立這類圖。
ar_diff 物件包含差異性結合分析的結果。
本練習屬於課程
在 R 中使用 Bioconductor 進行 ChIP-seq
練習說明
- 建立一個 Volcano plot。
- 檢視圖形。顯著的結果位於哪裡?
動手互動練習
試著完成這個範例程式碼,體驗一下這個練習。
# Create a volcano plot
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