เริ่มต้นใช้งานเริ่มต้นใช้งานได้ฟรี

สร้าง Boxplot

สำรวจชุดข้อมูลมะเร็งเม็ดเลือดขาว (leukemia) โดยแสดงระดับการแสดงออกของยีนแรกด้วย boxplot แยกตามผู้ป่วยที่มีอาการคงที่และที่มีอาการลุกลาม

แบบฝึกหัดนี้เป็นส่วนหนึ่งของหลักสูตร

การวิเคราะห์ Differential Expression ด้วย limma ใน R

ดูคอร์ส

คำแนะนำการฝึกหัด

เมทริกซ์การแสดงออก (x), ข้อมูล feature (f) และข้อมูล phenotype (p) ถูกโหลดไว้ใน workspace แล้ว

  • Subset x ให้เหลือเฉพาะยีนแรก (คือแถวแรก) แล้วนำไปใส่ทางด้านซ้ายของ ~ ในสูตร (แกน y)

  • Subset p ให้เหลือเฉพาะคอลัมน์ "Disease" แล้วนำไปใส่ทางด้านขวาของ ~ ในสูตร (แกน x)

  • Subset f ให้เหลือเฉพาะยีนแรก (คือแถวแรก) และคอลัมน์ "symbol" จากนั้นใช้ค่านี้เป็น argument ของ main สำหรับชื่อกราฟ

แบบฝึกหัดเชิงโต้ตอบแบบลงมือทำ

ลองทำแบบฝึกหัดนี้โดยเติมโค้ดตัวอย่างนี้ให้สมบูรณ์

# Create a boxplot of the first gene in the expression matrix
boxplot(___ ~ ___, main = ___)
แก้ไขและรันโค้ด