Kom igångKom igång gratis

Ser dessa prover likadana ut för dig?

Genom att granska PCA-plottar får du en uppfattning om likheter och skillnader mellan prover på global nivå. Med hjälp av utdata som genererades under QC av prover är det enkelt att skapa PCA-plottar av de bearbetade data. Nedan visas en plot för samtliga fyra prover som godkändes i QC.

Granska plotten och ta sedan ställning till följande påståenden. Vilka stämmer?

  1. Proverna klustrar efter betingelse.
  2. En plot som den här kan skapas med funktionen plotPrincomp().
  3. Med en PCA-plot är det enkelt att se vilka toppar som skiljer sig mest mellan grupperna.

Den här övningen är en del av kursen

ChIP-seq med Bioconductor i R

Visa kurs

Interaktiv övning med praktiskt arbete

Gör teori till handling med en av våra interaktiva övningar

Starta övningen