ComeçarComece de graça

Essas amostras parecem iguais para você?

Examinar gráficos de PCA permite que você tenha uma noção das semelhanças e diferenças entre as amostras em escala global. Usando a saída gerada durante o QC das amostras, é simples gerar gráficos de PCA dos dados processados. Abaixo está um gráfico para as quatro amostras que passaram no QC.

Analise o gráfico e depois avalie as afirmações a seguir. Quais são verdadeiras?

  1. As amostras se agrupam por condição.
  2. Um gráfico como este pode ser criado com a função plotPrincomp().
  3. Usando um gráfico de PCA é fácil ver quais picos mais diferem entre os grupos.

Este exercício faz parte do curso

ChIP-seq com Bioconductor em R

Ver curso

Exercício interativo prático

Transforme a teoria em ação com um de nossos exercícios interativos

Começar o exercício