Het gistgenoom ontdekken
Je gaat zelf het gistgenoom verkennen met het pakket BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, dat al voor je is geïnstalleerd.
Net als bij andere data in R kun je head() en tail() gebruiken om het object yeastGenome te verkennen. Je kunt het genoom ook per chromosoom subsetten met $-syntaxis zoals volgt: object_name$chromosome_name.
De namen van de chromosomen kun je opvragen met de functie names(), en met nchar() tel je het aantal tekens in een sequentie.
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
Introductie tot Bioconductor in R
Praktische interactieve oefening
Probeer deze oefening eens door deze voorbeeldcode in te vullen.
# Load the yeast genome
___
# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___