Waarom fastq?
Tot nu toe heb je kennisgemaakt met het ShortRead-pakket met handige tools voor de eerste stappen van short-read sequence-analyse. Samengevat zijn de belangrijkste functionaliteiten van dit pakket:
- Data-invoer
- Kwaliteitsbeoordeling
- Datatransformatie
- Toegang tot downstream-analyse
In deze context heb je twee verschillende bestandstypen gezien: fasta en fastq.
Wat denk je is de reden om fastq-geformatteerde bestanden te gebruiken?
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
Introductie tot Bioconductor in R
Interactieve oefening met praktijkervaring
Zet theorie om in actie met een van onze interactieve oefeningen
Begin oefening