BiocManager om pakketten te installeren
BSgenome is een Bioconductor-gegevenspakket met representaties van meerdere genomen. Dit pakket is al voor je geïnstalleerd, omdat het installeren van de afhankelijkheden meestal wat tijd kost, met de volgende code:
# Install BSgenome
BiocManager::install("BSgenome")
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
Introductie tot Bioconductor in R
Oefeninstructies
- Gebruik
library()om het pakketBSgenomete laden. Let op:BSgenomeis al voor je geïnstalleerd. - Lees de uitvoerberichten en bekijk de vereiste pakketten.
- Controleer de versies van alle pakketten die in de sessie zijn geladen.
Interactieve oefening met praktijkervaring
Probeer deze oefening door deze voorbeeldcode aan te vullen.
# Load the BSgenome package
___
# Check the versions of the packages loaded in the session
___