Aan de slagGa gratis aan de slag

Een sequentievenster

Om delen van je sequenties tijdelijk op te splitsen, gebruik je het concept van vensters met een opgegeven breedte die in stappen kunnen verschuiven. Zoals je in de video hebt gezien, biedt GRanges de functie slidingWindows() met argumenten zoals width en step.

slidingWindows(x, width, step = 1L)

Het GRanges-object met de naam ABCD1, met gen-id 215 en lengte 19895, is voor deze oefening al ingeladen. Gebruik de functie ranges() om de structuur te bekijken.

ranges(ABCD1)

Als je precies 2 vensters nodig hebt met step = 1L, wat is dan de maximaal toegestane breedte van elk venster?

Deze oefening maakt deel uit van de cursus

Introductie tot Bioconductor in R

Cursus bekijken

Praktische interactieve oefening

Zet theorie om in actie met een van onze interactieve oefeningen.

Begin met trainen