Biostrings manipuleren
Met een korte sequentie (dna_seq) uit het zikaVirus-object is het jouw beurt om aan de slag te gaan met de twee biologische processen transcriptie en translatie.
In de eerste twee delen van deze oefening pas je deze processen apart toe. In het laatste deel voer je ze in één stap uit.
Je gebruikt in deze oefening een heel kleine sequentie, maar onthoud dat de kracht van Biostrings vooral zichtbaar wordt bij het bewerken van veel grotere sequenties.
Het pakket Biostrings is al voor je geladen. Met zikaVirus vertaal je de eerste 21 tekens naar een AAString.
Deze oefening maakt deel uit van de cursus
Introductie tot Bioconductor in R
Praktische interactieve oefening
Probeer deze oefening eens door deze voorbeeldcode in te vullen.
# Unlist the set, select the first 21 letters, and assign to dna_seq
dna_seq <- subseq(___(___), end = 21)
dna_seq
# Transcribe dna_seq into an RNAString object and print it
___ <- ___(dna_seq)
rna_seq