1. Learn
  2. /
  3. Cursuri
  4. /
  5. Úvod do Bioconductoru v R

Connected

exercițiu

Objevování genomu kvasinek

Teď si sám/sama prozkoumáš genom kvasinek pomocí balíčku BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, který je už nainstalovaný.

Stejně jako u jiných dat v R můžeš použít funkce head() a tail() k prozkoumání objektu yeastGenome. Genom také můžeš procházet po chromozomech pomocí syntaxe $: název_objektu$název_chromozomu.

Názvy chromozomů získáš funkcí names() a počet znaků v sekvenci spočítáš pomocí nchar().

Instrucțiuni 1/3

undefined XP
    1
    2
    3
  • Načti balíček genomu kvasinek BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3 a přiřaď ho do proměnné yeastGenome.