Objevování genomu kvasinek
Teď si sám/sama prozkoumáš genom kvasinek pomocí balíčku BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3, který je už nainstalovaný.
Stejně jako u jiných dat v R můžeš použít funkce head() a tail() k prozkoumání objektu yeastGenome. Genom také můžeš procházet po chromozomech pomocí syntaxe $: název_objektu$název_chromozomu.
Názvy chromozomů získáš funkcí names() a počet znaků v sekvenci spočítáš pomocí nchar().
Toto cvičení je součástí kurzu
Úvod do Bioconductoru v R
Interaktivní cvičení na vyzkoušení si v praxi
Vyzkoušejte si toto cvičení dokončením tohoto ukázkového kódu.
# Load the yeast genome
___
# Assign data to the yeastGenome object
yeastGenome <- ___