Sekvenční okno
Pro dočasné rozdělení úseků sekvencí použiješ koncept oken o dané šířce, která se posouvají po krocích. Jak jsi viděl/a ve videu, GRanges nabízí funkci slidingWindows() s argumenty jako width a step.
slidingWindows(x, width, step = 1L)
Objekt GRanges s názvem ABCD1, který má id genu 215 a délku 19895, je pro toto cvičení již načtený. Pomocí funkce ranges() si prohlédni jeho strukturu.
ranges(ABCD1)
Pokud bys potřeboval/a získat přesně 2 okna s step = 1L, jaká je maximální povolená šířka každého okna?
Toto cvičení je součástí kurzu
Úvod do Bioconductoru v R
Interaktivní praktické cvičení
Proměňte teorii v praxi s jedním z našich interaktivních cvičení
Začít cvičení