Sekvenční okno

Pro dočasné rozdělení úseků sekvencí použiješ koncept oken o dané šířce, která se posouvají po krocích. Jak jsi viděl/a ve videu, GRanges nabízí funkci slidingWindows() s argumenty jako width a step.

slidingWindows(x, width, step = 1L)

Objekt GRanges s názvem ABCD1, který má id genu 215 a délku 19895, je pro toto cvičení již načtený. Pomocí funkce ranges() si prohlédni jeho strukturu.

ranges(ABCD1)

Pokud bys potřeboval/a získat přesně 2 okna s step = 1L, jaká je maximální povolená šířka každého okna?

Možné odpovědi

Délka genomu

Délka objektu GRanges minus 1

Délka objektu GRanges

Libovolná menší délka

.css-6su6fj{-webkit-flex-shrink:0;-ms-flex-negative:0;flex-shrink:0;}cvičení

Pokyny

Možné odpovědi

cvičení